台灣是地球上少數有生長檜木的國家，更是地球上唯一有形成檜木林的地方，
目前地球上已知的檜木就只有六種，而生長在台灣的檜木，就佔了兩種;其餘坊間稱檜木皆不是正統的檜木，都只是為了提高身價而仿其檜木之名。
而中國大陸的廣大土地並沒有生長"扁柏屬"的植物，古書上所稱的「檜」指的是龍柏，並不是現在被稱為「檜」的扁柏屬植物。在西方植物分類學上，生長在台灣的台灣扁柏與紅檜，與生長在中國大陸的龍柏，雖同為裸子植物，同屬於柏科，但卻為不同的屬，龍柏是圓柏屬，台灣的兩種皆為扁柏屬。

目前地球上的六種檜木如下，松柏類.柏科.扁柏屬:
1.台灣扁柏(黃檜/厚殼)，俗名:hinoki(日)
2.台灣紅檜(薄皮) ，俗名:meniki(日)
3.日本扁柏(黃檜) ，俗名:hinoki falsecypress
4.日本花柏(翠柏) ，俗名:Sawara falsecypress
5.美國羅森扁柏(美洲花柏)，俗名:lawson cypress;Port-Orford-cedar
6.大西洋雪杉(雪松;側葉扁柏;尖葉扁柏)，俗名:Atlantic white-cedar
原本的第七種.阿拉斯加黃杉(扁柏;花柏;拿加遜扁柏)，俗名:Alaska a yellow-cedar
(近年分類學更改屬類，從2004年學名改:Callitropsis Nootkatensis)

台灣的兩種檜木，台灣紅檜(Meniki)與台灣扁柏(Hinoki)，被全世界公認材質非常佳的檜木品種。皆為松柏類柏科扁柏屬，故統稱為台灣檜木，為常綠喬木，葉尖硬似柏樹，乾枯後像松樹，屬高山針葉樹種，是植物中帶氧量最多的一種植物;大部份生長於台灣高山海拔約1500公尺至2500公尺之間的高冷深山中，但也因台灣(1)平原到高山，高低直聳，尤其是中央山脈特殊地理環境，可一瞬間從海平面陡升到近四千公尺的堅聳地理，擋住了台灣多颱風與延遲了人為的破壞(2)位在熱、暖、寒三帶的緯度，屬海島型氣侯多豪雨、多颱風、潮溼易滋生細菌、黴菌的環境，卻因檜木本身的優勢，具有抗菌抗腐蝕，即使在如此惡劣的條件下都能不畏困境生存，造就了台灣檜木的優越品質，只是生長非常緩慢，但年樹齡上百年，上千年的神木卻也大多屬於此類，目前已知最久約三、四千年以上樹齡);若是一般樹種，在上述困境中，早就枯萎或毀損。

台灣紅檜與台灣扁柏，年輪細密，色澤高雅，皆含有特殊的氣味，因此昆蟲對此產生忌避作用，造成不易被蟲蛀侵蝕;在保存上耐朽力也高，不易腐蝕。但雖不易腐蝕，也不易蛀蟲，但並不是百分之百保證，天然的東西，還是要注意保存的場所與環境 (ps:所有種類木材均需避陽光日晒，勿存放溫差過大環境。)保存的好，可放上好幾百年，甚至千年不成問題(例如:台灣留存的日式檜木建築及台灣檜木家具，還有日本許多古老神社的檜木建築，尤其是日本奈良法隆寺五重塔，是目前已知世界最早的檜木建築，有一千三百年歷史且當時負責維修的宮廷木匠用刀一削，悶在裡頭的精油，即使是經過一千三百多年，還釋放出的檜木獨特的香味，令大家感到非常驚訝)。不過年代久遠的檜木，內含的味道的濃厚，也是要看那塊檜木本身的含油量多寡與保存的如何。

台灣紅檜與台灣扁柏的簡單分別:
(1).台灣紅檜，俗名松羅、薄皮(樹皮的剝片較薄，裂溝淺而稱之)，其葉為細小片膦片狀，緊貼於扁平枝條上，兩兩相對;也因心材呈淡紅色，故名"紅檜"，質地細柔而結實，內含油脂略香無辛味，耐朽，抗蟲性強。分佈於台灣海拔約850至2800公尺之間，最盛處約為1500-2150公尺，為目前台灣高山主要造林樹種，阿里山神木即為此種。(紅檜分佈海拔，供參考，眾說分云)
(2).台灣扁柏，俗名厚殼(樹皮剝片較厚，裂溝較深而稱之)、松羅、黃檜(也因心材黃褐色，故名"黃檜")，其鱗葉先端鈍厚，毬果圓形，乃與紅檜之鱗葉先端尖銳，毬果呈橢圓形易於區別。木材較有光澤，因內含油脂量通常較紅檜多一點且有微辛辣香味，耐朽，抗蟲性強。分佈於台灣每拔約1300至2800公尺間，在較高海拔常形成純林，較低處與紅檜混交，且在生長上也較紅檜為慢許多。

有此一說，在檜木林聽不到鳥聲，
西元1995年Hinoki新藥的創始者，阿部武夫說在幾十年前研究檜木時，曾到迥青森縣下，北半島的萬研溫泉，在那兒有檜木原始林。當時據了解這原生林的人告訴他說，有點奇怪的是，吸的森林能聽到鳥叫聲，但這裏的檜木木卻聽不到鳥叫聲。其實這是有理由的，因為檜木蟲子少，所以鳥不棲息在檜木樹上。

在日本統治台灣的日據時期，日本人發現台灣森林富藏大量檜木林以後，為了檜木不惜成本，開劈山林，設置了阿里山森林鐵路只為了方便把大量的檜木運送下山，二十多年中在台灣大量砍伐檜木，運往日本。台灣光復後，政府林務局也以林養農，繼續開採砍伐檜木林外銷日本及世界各國，一直到89年5月才禁採，並驚覺要保護所剩不多的檜木林，並把台灣檜木列為國寶級樹種，加以保育及進行復育。

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